Ağız kokusunun yüzde 90’ını ağız içi problemlerden, yüzde 10'u ise sindirim ve solunum sisteminden kaynaklıdır.Sindirim sisteminde ağız kokusuna sebep olan en önemli neden Helicobacter Pyloridir. Sindirim sistemi problemleri olan kişilerde ağız kokusu daha çok çürük yumurta kokusunu andırmakta ve özellikle geğirmeyi takiben bu koku daha fazla hissedilmektedir.
Ağız kokusuna karın ağrısı, karında şişkinlik, kilo kaybı, bulantı gibi semptomlar eklenmiş ise bakterinin tanısı için midenin endoskopik incelemesi (gastroskopi) gereklidir. Eğer sadece ağız kokusu mevcut ise bu gibi durumlarda Helicobacter Pylori için noninvaziv testler (üre-nefes testi ve dışkıda helicobacter pylori antijeni) yapılarak bu bakterinin varlığı tespit edilebilmektedir.
Helicobacter Pylori, ailesinde birinci derece akrabalarında mide kanseri olanlar için mide kanseri riskini artırmaktadır. Bu nedenle erken tanı için Gastroenteroloji muayenesi önerilmektedir.